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Comment gérer sa comptabilité avec Shopify : tour d’horizon des solutions possibles
Comment gérer sa comptabilité avec Shopify : tour d’horizon des solutions possibles
par Guillaume Beghin
sur Sep 27, 2025
Shopify est un outil puissant pour développer ses ventes en ligne, gérer ses produits et ses clients. Mais lorsque l’on aborde la comptabilité, beaucoup d’e-commerçants s’interrogent : faut-il gérer ses factures dans Shopify, via un ERP, ou utiliser un logiciel, une application complémentaire ?
La réponse dépend de votre organisation, de votre volume de commandes et du temps que vous souhaitez consacrer à l’administratif.
L’export manuel des ventes Shopify
La première solution consiste à exporter régulièrement les ventes Shopify au format CSV ou Excel pour les transmettre à son expert-comptable, selon les comptables cela sera plus ou moins simples et le traitement sera facturé différement.
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✅ Simplicité et gratuité.
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❌ Risques d’erreurs, perte de temps, manque de suivi en temps réel.
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🎯 Convient aux petits volumes de commandes ou aux boutiques qui débutent.
La gestion via un ERP connecté à Shopify
Pour les PME déjà équipées, il est fréquent de connecter Shopify à un ERP (Sage, EBP, Cegid, etc.).
Dans ce cas :
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Shopify transmet les commandes à l’ERP.
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L’ERP gère la facturation et centralise la comptabilité.
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Les factures peuvent ensuite être renvoyées à Shopify pour mise à jour.
👉 L’avantage : une gestion centralisée et robuste.
👉 La limite : la mise en place peut être coûteuse et technique.
➡️ Pour en savoir plus, consultez notre page dédiée aux connecteurs ERP/CRM
Utiliser une application connectée pour simplifier la gestion
Une autre approche consiste à utiliser un logiciel spécialisé connecté à Shopify pour automatiser la facturation et le suivi financier.
C’est la solution idéale pour les TPE/PME qui veulent gagner du temps sans déployer un ERP complet.
Exemple concret : Facturii by Sinao
Facturii by Sinao est une application conçue pour simplifier la comptabilité des e-commerçants Shopify. Elle permet de :
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Émettre automatiquement des e-factures conformes.
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Gérer les devis et relances clients.
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Réaliser le rapprochement bancaire automatiquement.
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Suivre la trésorerie et la rentabilité en temps réel grâce à des tableaux de bord intuitifs.
➡️ C’est une solution simple et rapide à mettre en place, parfaitement adaptée aux marchands Shopify qui cherchent à automatiser leur comptabilité sans complexité technique.
Tableau comparatif des solutions de gestion comptable avec Shopify
Solution | Avantages principaux | Limites | Pour qui ? | Coût estimé 💰 |
---|---|---|---|---|
Export manuel (CSV/Excel) | Simple, aucune intégration | Chronophage, erreurs fréquentes, pas de vision en temps réel | Petites boutiques, faible volume | € à €€€€ |
Connexion à un ERP | Gestion complète (commandes, stocks, factures, compta) | Intégration à vérifier selon le logiciel, coût à mesurer, complexité technique. | PME/ETI déjà structurées | €€ à €€€€ |
Application connectée (ex. Facturii by Sinao) | E-factures automatiques, devis, rapprochement bancaire, suivi financier | Abonnement à prévoir, solution complémentaire | TPE/PME recherchant rapidité et simplicité | € à €€ |
Conclusion
Il existe plusieurs manières de gérer sa comptabilité avec Shopify :
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L’export manuel, pour les petites structures,
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L’ERP connecté, pour les entreprises déjà organisées,
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Les applications spécialisées comme Facturii by Sinao, pour une automatisation simple et efficace.
👉 Chez Huggii nous vous aidons à connecter votre site e-commerce Shopify à vos outils de gestion (ERP, CRM, facturation) pour simplifier votre quotidien et sécuriser votre comptabilité.